Простите, мне кажется, что именно для этого - получить присланные данные в читаемом виде.

Ваши слова "оказалось Thunderbird умеет собирать подобные сообщения и намного эффективнее [названия ряда программ]" как-то не вяжутся с "с помощью внешнего декодера uue файлов".
Пока мы остановились на том, что в настоящее время в Thunderbird не реализовано (ни штатно, ни в виде плагинов к нему) склеивание частей письма. Тем более автоматически по получении, как это сделано в ряде программ, о которых Вы упомянули. Подобные письма встречаются довольно редко, но обидно, что Thunderbird имеет такое упущение.

Сам мучался: приходилось отправлять doc-файлы с длинными именами. Как временная мера - упаковывать в zip с коротким именем, иначе никак.

Еще как.
Из серии: "Предупреждать надо". В качестве эксперимента захотел посмотреть как выглядит почтовый клиент в Опере, благо она установлена. При настройке Опера предложила импортировать данные из доступных источников, в том числе из Thunderbird. Результат порадовал - столько когда-то удаленных в Thunderbird сообщений можно почитать...
Если уж сам не показываешь (считаешь "удаленными"), то и другим отдавать не стоит.