Хочу! У меня вообще приказали долго жить все ftp-ссылки. Х(

Вероятно, не выйдет
Смысля такая - Фокс всегда будет открывать протоколы которые он способен открыть самостоятельно.
ФТП - он может открыть сам и внешние приложения (через Вин Апи) запускать не станет.
Пример - если у вас стоит Mirc и вы кликнули на ссылку irc://(причем у вас не установлена chatzilla), то Фокс откроет ссылку исходя из системной регистрации протоколов, то есть Запустит Мирку и подключит её по указанному в ссылке серверу, а если у вас установлена chatzilla в Фоксе - то он откроет ссылку сам, запустив расширение, не обращаяя внимания на на то, на какое приложение зарегистирован этот протокол.
Так что...очень смоневаюсь, что у вас будет открываться коммандер, да еще ему будут передаваться данные о фтп соединении.