А поподробнее можно??? Просто у меня нет такого файла.

Файл user.js по синтаксису аналогичен  pref.js
При создании нового профиля user.js копируется из папки defaults/profile/ в профиль пользователя.  В итоге в профиле мы имеем и pref.js, и user.js. Разница в том, что user.js переопределяет переменные thunderbird-а, которые установлены в файле pref.js.

я это реализовал вот так:
user_pref("ldap_2.servers.default.filename", "default.mab");
user_pref("ldap_2.servers.default.replication.lastChangeNumber", 0);
user_pref("ldap_2.servers.default.uri", "moz-abldapdirectory://default.mab");
user_pref("ldap_2.servers.history.replication.lastChangeNumber", 0);
user_pref("ldap_2.servers.ldap.auth.savePassword", true);
user_pref("ldap_2.servers.ldap.description", "ldap");
user_pref("ldap_2.servers.ldap.filename", "abook.mab");
user_pref("ldap_2.servers.ldap.uri", "ldap://example.com:389/??sub");
user_pref("ldap_2.servers.pab.replication.lastChangeNumber", 0);

можно еще добавить строку:
user_pref("mail.identity.id1.directoryServer", "ldap_2.servers.ldap");

устанавливает наш сервер по умолчанию