Мне помогла строка-перенаправление страницы на саму себя: header("location: url"). Эту строку я ставила в js-файл после отправки данных аяксом.
Подробнее об этом - вот здесь http://www.softtime.ru/forum/read.php?id_forum=1&id_theme=66113.
Что же касается вопроса: "А зачем это убирать?", так ведь если человек делает сайт на заказ, то заказчик сам скажет:"Уберите!", ибо все эти неожиданно всплывающие и предупреждающие "непонятно о чём" окошки, распугивают посетителей сайта...