К некоторым таймаутам имеются дополнительные условия. Например для таймаута прокси - это условие что его настройка осуществляется через PAC (proxy auto-configuration). Для этого, наверное, понадобится несколько прокси, либо каким-то образом использовать локальный прокси в качестве второстепенной заглушки.
network.proxy.failover_timeout = сколько секунд ожидать (таймаут) перед повторным подключением к недоступному прокси, но при условии, что
network.proxy.type = 2 (PAC)
Возможно, для конфигурации PAC поможет расширение FoxyPAC

Как другой вариант - использовать локальный прокси-сервер, который при недоступности внешнего прокси, выдавал бы определенную html-страницу, на которой смог бы запуститься скрипт (userscript из *monkey), так как страница "прокси-сервер отказывается принимать соединения" - служебная и запуск userscript на ней запрещен, как и работа расширений