Добрый день.
Где настройки автозапуска?
Нужно при старте windows запускать свернутым в трей, а так же при закрытии на крестик или esc сворачивать в трей.

Расширения не помогают:
MinimizeToTray не решает проблему с запуском, а Minimize On Start and Close сворачивает на панель задач, а не в трей.