Накануне ничего не происходило. Утром открыла Thunderbird, он долго не запускался, а когда запустился, предложил мне создать новую учетную запись. Ничего нет. Ни писем, ни учетных записей. Ужас.

Thunderbird по какой-то причине не нашёл профиль пользователя.
В такой ситуации первым делом нужно заглянуть в тот каталог диска, где этот профиль должен находиться, (%APPDATA%\Mozilla\Thunderbird\profiles) и посмотреть, что там творится.

Из этой фразы я ничего не поняла. Но, антивирус нашел поврежденный файл со словами APPDATA. Получается, что вирус повредил какой-то файл, связанный с учетными записями?

Откройте любую папку любого диска, в её адресную строку вставьте %APPDATA%\Mozilla\Thunderbird\profiles (скопировав отсюда) и нажмите Enter. В результате должна открыться та папка, где находятся профили пользователей Thunderbird.
В качестве первого шага интересует, что там будет видно и будет ли там вообще что-то, так как:

APPDATA - это не файл, а каталог. И если аж антивирус увидел его как файл и на что-то заругался, то это очень нехороший признак. Нет, не наличия вируса, а какого-то серьёзного повреждения структуры файловой системы диска. В таком случае тем более интересно, что же там, на диске, сейчас находится. Но, к сожалению, в таких ситуациях довольно тяжело разбираться по переписке.
(Всё, до вечера буду недоступен для общения.)

Добрый день. Заново создала учетные записи, обновила Thundebirds. Попробовала вставить слова %APPDATA%\Mozilla\Thunderbird\profiles в поиск, но компьютер ничего не нашел ни на одном диске. Почтовый клиент пока работает, но почта с gmail.com вообще не хотела устанавливаться. На фоне ажиотажа по работе это подлость какая-то.

Операционная Система какая?

Вот по тому я не храню почту в профиле, а указываю отдельно место.
Поищите файл "Inbox" он должен быть в каждой почте.
Когда найдёте письма, перенесите их в новые папки и они "появятся".

Естественно, не найдёт. Не в поиск надо было вставлять, а в строку адреса.

На Gmail с безопасностью накрутили такое, что сейчас, по-моему, даже самая последняя официальная версия Thunderbird регистрацию пользователя пройти не может. Только в последних ночных сборках проблема решена.

Спасибо всем за ответы. В понедельник начну заниматься почтой. Тогда попробую сделать то, что здесь посоветовали. Операционная система Windows7 64.

Исправлял свои ошибки и нашёл отличную статью на Народе
http://aceq7.narod.ru/ru/thunderbird-vosstanovlenie-pisem/thunderbird-vosstanovlenie-pisem.htm
Думаю будет полезно глянуть.

Использую только IMAP, чего и всем советую.