Собственно имею проблему. Не проверяется почта по расписанию, не применяются автоматически фильтры при получении вручную. Thunderbird 38.2.0 под Ubuntu 14..04.3 LTS. Выставлял различные Периоды проверки, от необходимых мне 3-х минут до 10 минут. Галка автоматической проверки стоит, дополнений не установлено. Почта настроена по протоколу IMAP, авторизация по STARTTLS "Обычный пароль". При выборе папок - происходит проверка и новые письма появляются... Но... Не применяются фильтры к полученной почте. При применении фильтров по очереди к каждой папке - фильтры отрабатывают.

Уже и пересоздавал ящик, и удалял папку конфига. После настройки почты - всё по-новой.

Правой кнопкой на папке\Свойства\Основная информация - "При получении новых сообщений для этой учетной записи всегда проверять эту папку"

Фильтры применяются только к папке "Входящие" (а начиная с 38-й версии - даже к папке "Отправленные"! шел 2015-й год...)

Спасибо, даже подумать о таком не мог!!

О майн год!! Да что ж за... Ну никак не ожидал... И никак не исправить ситуацию? Не заставить фильтровать письма во вложенных папках IMAP?

В общем, нашёл решение, как заставить Thunderbird применять фильтры и для подпапок.
Открыть редактор настроек, создать строковой параметр с именем mail.server.default.applyIncomingFilters и значением true .

После этого фильтры должны применяться к папкам со всеми их подпапками.

Вопрос закрыт.