Существует сайт , в нем под гиперссылкой "смотреть" спрятан адрес типа sop://broker.sopcast.com:3912/146347, при попытке вызвать контекстное меню и скопировать данный адрес происходит автозапуск приложения отвечающего за данный тип ссылок и контекстное меню мгновенно исчезает. Существует ли возможность все-таки вызывать контекстное меню, и производить запуск/копирование уже из под него?

Ну, можно попробовать установить в about:config

dom.event.contextmenu.enabled в false

Это запретит скриптам изменять контекстное меню, но как минус на многих сайтах (дроп бокс, всякие онлайн редакторы и т.п.) контекстное меню станет двойным

Проблема решилась удалением плагина TorrentStream Magic Player...