Необходимо настроить почтовый клиент так, чтобы его можно было конфигурировать с файла cfg. Читаю статью на хабре http://habrahabr.ru/post/101905/ не могу найти файл greprefs/all.js, в котором все настройки. Попробовал открыть 7зипом omin.ja, там лежит файл greprefs.js и несколько папок. Что с ним делать, его вместе с папками распаковать? Нужна помощь..

omin.ja\default\pref\all-thunderbird.js

Сделал немного подругому, создал autoconf.js и в нем сделал привязку thunderbird.cfg, где можно посмотреть описание настроек на русском языке?

С миру по нитке. Я это серьезно.
Тем более на русском языке.
Я собирал по чуть-чуть, в том числе с вышеуказанного сайта на хабре.
Сейчас добился того, что можно посадить нового пользователя за комп под новой учетной записью, он запустит птицу и у него сразу будет готова к работе почта, общий календарь и общая адресная книга. Все без ввода пароля со стороны пользователя.
Правда есть нюансы: например у меня почтовый сервер (Postfix+Dovecot) настроен так, что выгребает сведения о почтовой учетке из AD ldap, а аутентификация происходит через kerberos (В птице соответственно используется возможность аутентификации пользователей через GSSAPI, что служит мостиком к тому же kerberos)
Если интересует, могу скинуть файл thunderbird.cfg

Так что Exchange в связке с Outlook не просто отдыхает, а истерически докуривает последнюю пачку сигарет в стороне.