Собираюсь перейти на Linux и меня интересует вопрос импорта-эспорта почты и настроек из Windows(2000).

Берем папку Mail из профиля, создаем новый профиль в линухе, закрываем птицу, удаляем папку Mail из нового профиля, копируем туда виндовую папку, открываем птицу и наслаждаемся результатом

Если ты собираешься не полностью переходить на линукс, а сидеть и там и там, то:
Профили от Firefox и Thunderbird у меня хранятся на диске D. Когда поставил FF и TB на линукс - зашел через Profile Manager и создал профили, папками которых были те же что и для винды.

Из за этого мне не надо было думать откуда я принимал почту (из винды или из линукса), да и все остальное (закладки, настройки и т.д.)

Видимо, имелось в виду, что у него диск D отфарматирован в FAT. На других файловых системах ничего хорошего не получится. При таком способе нельзя устанавливать платформо-зависимые расширения (minimize to tray).

или можно сделать сиволическую ссылку на виндовый профиль...

RED

Лучше не на профиль, т.к. похерится он. Лучше на папки с учетными записяпи (мыльными ящиками), предварительно создав такую же учетку в линуховой версии TB.
Я так уже полгода живу. Все рулем

Athathoth
кстати, у меня именно так
ln -s /виндовый путь/Mail ~/профиль/Mail

кстати, при этом глючат виртуальные папки. в любых версиях. надоело мне это - не так давно убрал их все.

RED
/профиль/Mail - это разве путь до профиля? Вот был бы путь /профиль, тогда имели бы траблы.
Я не помню точно что за геммор поимел, решив скрестить юниховый профиль с виндовым (до этого был еще один геммор, но там mozilla скрещивалась с Thunderbird ), но кажется руками пришлось править .rdf файлы чтобы все восстановить.

в wiki написана структура профиля
что тебе надо то и переноси