На Gmail есть несколько ярлыков, которые соответственно появились в ТБ.
Как добиться того чтоб в ТБ была папка в которой были бы видны только «безЯрлычные» письма?

Вопрос очень хороший . Я придумал решение (довольно варварское), но столкнулся с проблемами при реализации.

Идея решения такая. Нужно установить Filtaquilla (вообще полезная вещь) и в её настройках задать возможность использовать собственный JavaScript при поиске. Затем создать виртуальную папку, отображающую такие сообщения из «All Mail», для которых в папках ярлыков нет сообщений с идентичным Message-ID.

В первом приближении код выглядит так:

let messageID = message.messageId;

let subfolders = Cc["@mozilla.org/supports-array;1"]
            .createInstance(Ci.nsISupportsArray);

Cc["@mozilla.org/messenger/account-manager;1"]  
            .getService(Ci.nsIMsgAccountManager)
            .FindServer('mylogin@gmail.com', 'imap.googlemail.com', 'imap')
            .rootFolder
            .ListDescendents(subfolders);
(
    (
    function()
    {
    for each (let subfolder in fixIterator(subfolders, Ci.nsIMsgFolder))
        {
        if (!subfolder.getFlag(0x40405720))
            {
            let messages = subfolder.messages;
            while(messages.hasMoreElements())
                {
                    let _message = messages.getNext();
                    if (_message.messageId == messageID) {return false;} 
                }
            }
        }
    return true;
    }
    )()
)

Проблема в том, что _message.messageId чаще всего undefined. Не всегда, конечно. Если письмо с ярлыком было только что просмотрено, то соответствующий nsiMsgDBHdr всё-таки имеет правильный messageId.

Значение mailnews.customDBHeaders установлено в message-id, папки переиндексированы. Что ему ещё нужно, кто знает?

А не хватает ему сказанного в нужном месте следующего:

_message.QueryInterface(Components.interfaces.nsIMsgDBHdr);

uzi1, считаю вопрос решённым, если нужно что-то дополнительно разъяснить, спрашивайте.

далек я от JavaScript
какова окончательная редакция вашего труда?

ОК, последовательность действий такая.

1. Устанавливаете FiltaQuilla.
   
2. В настройках этого дополнения на вкладке «Search Terms» выставляете флаг «JavaScript».
   
3. В аbout:config находите параметр mailnews.customDBHeaders, выставляете его в "message-id" (без кавычек, в нижнем регистре). Если в значении параметра что-то есть, дописываете в него указанную строку через пробел.
   
4. Наверное, нужно перезапустить Thunderbird.
   
5. Переиндексируете папки с ярлыками и папку «All Mail» (я просто поудалял msf-файлы в профиле).
   
6. Нажимаете Ctrl+Shift+F, выбираете папку «All Mail», в условиях поиска выбираете «JavaScript» «подходит под» <код ниже>.
   Выделить код

   Код:

   let messageID = message.messageId;
   
   let subfolders = Cc["@mozilla.org/supports-array;1"]
               .createInstance(Ci.nsISupportsArray);
   
   Cc["@mozilla.org/messenger/account-manager;1"]  
               .getService(Ci.nsIMsgAccountManager)
               .FindServer('mylogin@gmail.com', 'imap.googlemail.com', 'imap')
               .rootFolder
               .ListDescendents(subfolders);
   (
       (
       function()
       {
       for each (let subfolder in fixIterator(subfolders, Ci.nsIMsgFolder))
           {
           if (!subfolder.getFlag(0x40405720))
               {
               let messages = subfolder.messages;
               while(messages.hasMoreElements())
                   {
                       let _message = messages.getNext()
                           .QueryInterface(Ci.nsIMsgDBHdr);
                       if (_message.messageId == messageID) {return false;} 
                   }
               }
           }
       return true;
       }
       )()
   )

   В восьмой строке нужно указать свой логин. Поиск дубликатов производится во всех папках, кроме стандартных и виртуальных.
   

7. Сохраняете как виртуальную папку. Выставлять флаг «Поиск онлайн» не следует.