При работе с Яндексом через IMAP TB создает дополнительные папки: Спам, Удаленные, Черновики, Отправленные.
Но на сервере у них английские названия.

В настройках imap аккаунта, раздел "Копии и папки". Там надо повыбирать "сохранять письма в другую папку" и выбрать сервер и папку.

Там можно настроить все кроме "Удаленных". С удаленными сложнее и описано здесь: http://kb.mozillazine.org/IMAP_Trash_folder