Причина - thunderbird где-то хранит настройки подключения к ящикам и при изменении этих настроек некорректно их меняет (или вообще не меняет - непонятно)

Иногда в этом случае помогает перезапуск ТВ, но увы, не всегда

Конкретика:

на рабочем компе, где есть 4 рабочие ящики pop3, нужно настроить ящик IMAP - не работает ни под каким макаром (просто-напросто не может соединиться с сервером).
На соседнем компе (где не было ранее учёток ТВ) всё работает.

Запускаете thunderbird -P и из менеджера профилей создаёте новый профиль.