После обновления версии (2)-исчезла папка Applikation data. Куда теперь сохраняются закладки?

Ulpan
Вряд ли такая папка вообще была.

Она не могла исчезнуть, скорее всего у вас не включено отображение скрытых файлов и папок, да поможет Google.

Добавлено Sun Dec  2 14:07:08 2007 :
Если вы разумеется о папке Application Data.

Поищи в C:\Documents and Settings\<имя юзера>\Local Settings\Application Data\Mozilla

Проще всего:
Пуск -> Выполнить -> %appdata%