В Thunderbird есть опция не скачивать письма большого размера, а только заголовки. При этом при открытии письма появляется сообщение "Нажмите здесь, чтобы загрузить сообщение полностью". В Windows эта функция работает корректно во всех режимах, в Linux же письмо отображается правильно только в трёхпанельном режиме (при включённой области просмотра сообщений)

Если же при выключенной области просмотра изображений открыть такое письмо и нажать ссылку для получения письма, письмо загружается, но не отображается в текущем окне. Для того, чтобы увидеть текст письма, нужно закрыть это окно и снова открыть письмо. Однако у неискушенного пользователя создаётся ощущение, что письмо просто не загружается. Такое поведение явно не является корректным

Ошибка присутствует и в 1.5.х, и в 2.0.0.5

=>Thunderbird

Кто-нибудь замечал такую же ошибку?

Было такое. Потом само собой прошло.
Имхо происходит какой-то сбой с индексами писем или еще что-то.