Можно ли сделать, чтобы Win и Lin версии использовали одну базу писем?

впринципе можно.
Твой профиль надо хранить на  Виндовс-партиции.
Линуксовому Тандербёрду указать путь до этого профиля.

у меня так. элементарно. просто путь один и тот же указываешь и там и там - и все. ничего не глючит.

Естесственно, что все письма должны лежать на ФАТ-партиции, а не на НТФС

Блин, у меня NTFS.

создай раздел FAT. мегов 50 хватит с запасом. и на нем держи почту. а вообще, у меня NTFS на разделе с самой XP, ext3 на втором винте, где Linux, а остальные 2 раздела (140 и 77 Гб) - FAT32. то есть, системы стоят как вкопанные, а остальное... видео на DVD-шки пишу, и одна DVD+RW шка - бэкап. ~3 гига софт и ~1 гиг документы.

Блин, неохота переразбивать - траблы есть после разбивки для Линя.

да мелочь же. просто уменьши один раздел на ~50Mb, и создай на его месте другой. вот и все :) Partition Magic тебе поможет.

Посмотри тут, как он мне помогает.