Да. Папки с письмами и prefs.js.
Фактически, я перенес папки с письмами в отдельную папку в корне виндового диска, и Тандербёрды под Мак и под Виндоус у меня довольно долго их делили.

Можно сделать так. Создать под Маком новый профиль. Учетные записи емэйлов. Направить папки с письмами на соответствующие папки на диске. Сделать копию prefs.js и записать в папку профиля prefs.js из Винды. И заново поставить расширения. Впрочем, prefs лучше не переносить.