Подобная проблема была, правда не с 1С предприятием, но продукт от них же, 1С:Архив. Поднят домен, большинство юзеров - пользователи домена, из архива не удавалось отправить файл с помощью Thunderbird, под админом выставил его как почтовик по умолчанию, запустил его, запустил 1с:Архив, все отправляется. Без первого запуска из-под админа, хоть почтовик и установлен по умолчанию, письмо, под пользователем домена, создавалось с помощью outlook.