Все настройки и письма хранятся в профиле и при удалении (естественно кооректном через панель управления) они не удаляются. Новая версия при установке подцепит их и все будет.  Но, стоит перед удалением старой версии опять же корректно удалить все расширения (в том числе и локализацию) и темы, чтобы избежать траблов с несовместимостью расширений с новой версией.
Не лишним будет и полный back-up профиля.

P.S. Вчера копаясь в своем профиле, обнаружил учетные записи, которые уже не используются, но так и кочуют начиная с версии Thunderbird 0.1

Пожалуйста, ткните меня носом, куда можно зайти и точно ( ШАГ за ШАГОМ) прочитать, как  обновить версию.
Везде отдельные советы (отрывки). Не нашла полной и точной инструкции( может я ослепла?)
Мне тяжело все собрать в "одну кучу".
И еще вопрос:
Русская версия Thunderbird 1.0 - Инсталлятор для Windows
Русская версия Thunderbird 1.0 - Русификация
Русская версия Thunderbird 1.0 - Linux Tarball
Я у меня стоит 0,9(русская сборка) , мне какую из этих трех качать?
Простите за тупизм!

Во вторым вопросом уяснила, а что с первым?
Неужели нет подробной инструкции?

У меня расширение стоит с переводом,  я им сейчас воспользовалась и почитала,  какой перевод получился ( просто ляпота). Сразу вспомнила слова Reda: переводит два раза: сначала с англ. на рус, а потом-еще раз то что получилось. Супер, у меня впереди много работы по переводу. Ничего-я справлюсь. Спасибо за наводку.