на сколько я знаю, отдельных системных переменных нет (что не мешает вам их сделать)
если пользователь указал путь к расположению профиля где-то в другом месте, то в вашем случае это будет указано в %userprofile%\Application Data\Thunderbird\Profiles\profiles.ini

Понятно, что я могу прописать любые. Хочется использовать имеющиеся. ничего не меняя на компьютере.
Задача простая - разливать расширения и темы для Лиса и Птицы. Для этого использую самораспаковывающийся архив с профилем. Приходится каждый раз указывать путь. Ну со стандартным путем просто, можно автоматизировать. но у своих клинетов, например, я профили перемещаю в "D:\Мои Документы".
Ну и в папку с программами нужно лить поисковые плагины для Лиса. в стандартное место - не проблема, но извращенцы разные бывают :о)