Я использую Privoxy (веб-прокси). Согласно инструкции https://www.privoxy.org/user-manual/startup.html в настройках сети Windows прописано использование Privoxy в качестве HTTP и HTTPS прокси с IP 127.0.0.1 и портом 8118.
В целом Privoxy выполняет свою функцию по фильтрации трафика, однако пока он включен, перестает работать протокол ESNI (технология сокрытия доменных имён; проверял на https://www.cloudflare.com/ssl/encrypted-sni)
Также не работает расширение Flagfox. https://imgur.com/a/qSNsFet
Тестировал на Firefox ESR v78, Privoxy v3.0.32, Windows 10 x64.
Пробовал использовать настройки Firefox по умолчанию с отключенными расширениями и Privoxy со стандартными параметрами в файлах user.action и config.txt и все равно не дает использовать, если активирован Privoxy 127.0.0.1:8118. Как только выключаю, все начинает работать: и флаги рисует Flagfox и зеленая галка ESNI появляется на тест-сайте cloudflare.
Есть ли способ заставить работать протокол Encrypted SNI и расширение Flagfox вместе с включенным Privoxy?

Попробуй переключить параметр network.proxy.socks_remote_dns когда активен privoxy - возможно, flagfox заработает.
ESNI по-идее и не должен работать совместно с privoxy. Так как в твоем случае firefox передает обязанность делать DNS запросы privoxy