Толи в настройках что-то не так, то ли редактор на самом деле не предназначен для PHP.
Когда открываешь PHP файл через него, пропадают все отступы и пустые строки. из-за этого неудобно разбираться в логике скриптов.
И неужели нет функии сворачивания кода (плюсики-минусы),
как здесь

Ну фактически да, редактор не предназначен для PHP. Ну то есть совсем. Смотрели аддон к Фоксу Codetch?